A principios de la década de los 60, se inicia la actividad de Virología con el traslado del Dr. Guillermo Contreras desde el Instituto de Bacteriologia (hoy, ISP). El obtuvo un Grant de la Fundación Rockefeller para formar una unidad de Virología (1962) que se ubicó inicialmente en un laboratorio cercano al antiguo casino (Laurita). Alrededor de 1966, por una proceso de reorganización (toma) de la Facultad, el grupo de Virología se ubicó finalmente en el subterráneo que hoy corresponde a Fisiopatología. Al Dr. Contreras, lo acompañaban Adela Olhbaum y Romilio Espejo.
La Unidad de Virología se traslada al lugar físico actual en 1971, donde se incorporan Carmen Grado, Elba Wu, Eliana Canelo y Valentina Riveros. El Dr. Raúl Caviedes y José Manuel Ojeda ocuparon una dependencia destinada a desarrollo de cultivos celulares. Cecilia Hidalgo y Bertold Frieldlander también trabajaron un tiempo en la unidad. El Dr. Contreras dejó el país en 1974.
Así se fue construyendo la unidad de virología, como parte del Departamento de Microbiología y Parasitología de la Facultad de Medicina Norte que fue dirigido por el Dr. Hugo Schenone (1973 a 1995) y por el Dr. Luis Fidel Avendaño (1995 a 1997). En 1998, se crea el Instituto de Ciencias Biomédicas, dando inicio al Programa de Virología, cuya primera Directora fue la Dra. Mónica Suárez, y tras su fallecimiento asumió el cargo el Dr. Avendaño (1999 a 2004). Luego lo sucedió la Dra. Carmen Larrañaga (2005 a 2012) y actualmente lo dirige el Dr. Aldo Gaggero (2013 al presente).